MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF MA0143.1 Sox2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 15 nsites= 667 E= 0 0.040480 0.665667 0.133433 0.160420 0.029895 0.677130 0.032885 0.260090 0.488789 0.010463 0.005979 0.494768 0.002990 0.014948 0.010463 0.971599 0.020927 0.001495 0.008969 0.968610 0.056801 0.124066 0.790732 0.028401 0.127246 0.005988 0.013473 0.853293 0.095808 0.290419 0.115269 0.498503 0.612613 0.186186 0.057057 0.144144 0.039039 0.058559 0.039039 0.863363 0.040602 0.115789 0.667669 0.175940 0.048120 0.634586 0.126316 0.190977 0.641566 0.061747 0.054217 0.242470 0.551205 0.100904 0.236446 0.111446 0.730422 0.090361 0.091867 0.087349 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0143.1 MOTIF MA0143.2 Sox2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 15 nsites= 669 E= 0 0.040359 0.666667 0.133034 0.159940 0.029895 0.678625 0.032885 0.258595 0.491779 0.008969 0.004484 0.494768 0.002990 0.014948 0.008969 0.973094 0.020927 0.000000 0.008969 0.970105 0.053812 0.124066 0.793722 0.028401 0.127246 0.005988 0.011976 0.854790 0.094311 0.291916 0.113772 0.500000 0.611111 0.187688 0.057057 0.144144 0.039039 0.055556 0.039039 0.866366 0.039098 0.115789 0.669173 0.175940 0.046617 0.636090 0.126316 0.190977 0.641566 0.063253 0.055723 0.239458 0.552711 0.100904 0.234940 0.111446 0.732628 0.090634 0.089124 0.087613 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0143.2 MOTIF MA0143.3 Sox2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 1476 E= 0 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.453252 0.000000 0.000000 0.546748 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.283875 0.201220 0.514905 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0143.3 MOTIF MA0143.4 SOX2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 85754 E= 0 0.339401 0.128752 0.249948 0.281899 0.353091 0.176715 0.200072 0.270122 0.973890 0.005084 0.004874 0.016151 0.015241 0.913730 0.014495 0.056534 0.951408 0.014052 0.006414 0.028127 0.942522 0.020314 0.023346 0.013819 0.056149 0.008536 0.010845 0.924470 0.115750 0.009329 0.855610 0.019311 0.172260 0.073046 0.634536 0.120158 0.336544 0.200084 0.207162 0.256210 0.337710 0.203781 0.186557 0.271952 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0143.4 MOTIF MA0143.5 SOX2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 7 nsites= 85754 E= 0 0.973890 0.005084 0.004874 0.016151 0.015241 0.913730 0.014495 0.056534 0.951408 0.014052 0.006414 0.028127 0.942522 0.020314 0.023346 0.013819 0.056149 0.008536 0.010845 0.924470 0.115750 0.009329 0.855610 0.019311 0.172260 0.073046 0.634536 0.120158 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0143.5