MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF MA0485.1 Hoxc9 letter-probability matrix: alength= 4 w= 13 nsites= 885 E= 0 0.265537 0.124294 0.453107 0.157062 0.126554 0.193220 0.605650 0.074576 0.099435 0.683616 0.045198 0.171751 0.253107 0.528814 0.001130 0.216949 0.746893 0.003390 0.231638 0.018079 0.000000 0.010169 0.000000 0.989831 0.841808 0.094915 0.039548 0.023729 0.995480 0.000000 0.000000 0.004520 0.993220 0.006780 0.000000 0.000000 0.020339 0.000000 0.000000 0.979661 0.054237 0.807910 0.005650 0.132203 0.640678 0.081356 0.006780 0.271186 0.159322 0.371751 0.180791 0.288136 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0485.1 MOTIF MA0485.2 HOXC9 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 21648 E= 0 0.200804 0.081301 0.717895 0.000000 0.000000 0.009370 0.000000 0.990630 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.214744 0.000000 0.785256 0.000000 0.000321 0.000321 0.000707 0.998651 0.881259 0.000000 0.000000 0.118741 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.999228 0.000772 0.000000 0.000000 0.691295 0.090432 0.060762 0.157511 0.209510 0.324110 0.140982 0.325397 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0485.2 MOTIF MA0485.3 HOXC9 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 21648 E= 0 0.200804 0.081301 0.717895 0.000000 0.000000 0.009370 0.000000 0.990630 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.214744 0.000000 0.785256 0.000000 0.000321 0.000321 0.000707 0.998651 0.881259 0.000000 0.000000 0.118741 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.999228 0.000772 0.000000 0.000000 0.691295 0.090432 0.060762 0.157511 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0485.3